El novedoso sistema de detección de recién nacidos utiliza el método rápido que

Detección de recién nacidos mediante secuenciación rápida del genoma completo

imagen: Debido a que la NBS altamente exitosa no ha seguido el ritmo de la innovación genómica o terapéutica, adaptamos rWGS para una NBS integral. NBS-rWGS para 388 trastornos tuvo una especificidad del 99,7 %, una sensibilidad del 88,8 % y podría haber evitado los síntomas por completo en siete de 2208 bebés en estado crítico, principalmente en 21 y parcialmente en 13.
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Crédito: Rady Children’s Institute for Genomic Medicine

San Diego—24 de agosto de 2022— El Rady Children’s Institute for Genomic Medicine (RCIGM®) anunció hoy la publicación de un estudio revisado por pares en el Revista americana de genética humana (AJHG) que describe un prototipo escalable para la detección de recién nacidos (NBS) que incluye el diagnóstico de enfermedades genéticas mediante secuenciación rápida del genoma completo (rWGS®) y orientación virtual para el manejo agudo.

RCIGM desarrolló el cribado de recién nacidos mediante el sistema de secuenciación rápida del genoma completo (NBS-rWGS)que realiza tanto el cribado como el diagnóstico con capacidad de autoaprendizaje para afinar y aumentar los resultados con el tiempo, en colaboración con:

  • Rady Children’s Hospital-San Diego
  • Instituto de Graduados Keck
  • Ilumina, Inc.
  • Alexion, AstraZeneca Enfermedad rara
  • Departamento de Pediatría, Universidad de California San Diego
  • Fabric Genomics, Inc.
  • Mass General Brigham, Broad Institute, Ariadne Labs y Harvard Medical School
  • genoma inc.
  • TileDB Inc.
  • Luna ADN

“Este sistema NBS-rWGS está diseñado para complementar el proceso de evaluación de recién nacidos existente y tiene el potencial de eliminar la odisea terapéutica y de diagnóstico que enfrentan muchos niños y padres”, dijo Stephen Kingsmore, MD, DSc, presidente y director ejecutivo de RCIGM y autor principal. . “Actualmente, solo se recomiendan 35 trastornos genéticos básicos para la detección de recién nacidos en los Estados Unidos, pero hay más de 7200 enfermedades genéticas conocidas. Los resultados siguen siendo malos para los recién nacidos con una enfermedad genética debido al número limitado de exámenes de detección recomendados. Con NBS-rWGS, podemos expandir ese número más rápidamente y, por lo tanto, mejorar potencialmente los resultados a través de la medicina de precisión”.

En el estudio, los autores utilizaron criterios establecidos, una técnica Delphi, captura electrónica de datos y el consenso de un panel de genetistas pediátricos sobre seis preguntas para determinar la inclusión de intervenciones y trastornos en Genome-to-Treatment (GTRx™), un sistema automatizado, sistema virtual de gestión de enfermedades que integra un diagnóstico rWGS con un sistema personalizado de gestión de información de laboratorio y canalización de análisis. Revisaron 457 enfermedades genéticas y seleccionaron 388 para su inclusión en NBS-rWGS. Después de simular NBS-rWGS en 454 707 sujetos del Biobanco del Reino Unido con 29 865 variantes patogénicas o probablemente patogénicas asociadas con estas 388 enfermedades genéticas, determinaron que NBS-rWGS tenía una especificidad del 99,7 %.

En 2208 niños gravemente enfermos con sospecha de trastornos genéticos y 2168 de sus padres, los investigadores encontraron que NBS-rWGS simulado identificó 104 de 119 diagnósticos realizados previamente por rWGS e identificaron 15 hallazgos no informados previamente. El valor predictivo negativo y la sensibilidad de NBS-rWGS (99,6 % y 88,8 %, respectivamente) fueron ligeramente superiores a los de diagnóstico rWGS. Las intervenciones anteriores pueden haber mejorado notablemente los resultados y reducido la hospitalización en 43 de los 104 niños gravemente enfermos.

El NBS-rWGS simulado identificó enfermedades genéticas en 15 recién nacidos que habían pasado desapercibidas en el cribado neonatal convencional. Además, en 60 de 104 niños con enfermedades genéticas identificadas por NBS-rWGS simulado, los investigadores calcularon que realizar NBS-rWGS dentro de los cinco días posteriores al nacimiento puede haber acortado el tiempo hasta el diagnóstico en una mediana de 73 días. Determinaron que esto podría haber evitado los síntomas por completo en siete de esos recién nacidos.

“Los resultados de este estudio demuestran el potencial de la detección de recién nacidos mediante la secuenciación rápida del genoma completo para ayudar a acortar el tiempo de diagnóstico de cientos de enfermedades genéticas”, dijo Tom Defay, coautor y director adjunto de desarrollo y estrategia de diagnóstico de Alexion. “Como parte de nuestro compromiso de ayudar a los pacientes y sus familias a obtener respuestas más rápido, continuamos colaborando con el Instituto de Medicina Genómica Rady Children’s mientras trabajan para mejorar y escalar esta tecnología innovadora”.

El 14 de junio de 2022, RCIGM lanzó formalmente NBS-rWGS con su nuevo nombre, Comienzos. RCIGM lanzará un estudio de investigación clínica que investiga la efectividad de BeginNGS para diagnosticar y proporcionar pautas de tratamiento para aproximadamente 400 afecciones genéticas graves de la primera infancia antes de que comiencen los síntomas. El estudio determinará la utilidad de GTRx para ayudar a los médicos a tomar decisiones de manejo de trastornos raros que quizás solo traten unas pocas veces durante su carrera. En etapas posteriores, comenzará la inscripción en el estudio, seguida de la expansión de las pruebas a ~500 trastornos. El objetivo final es que BeginNGS se convierta en el estándar de detección de enfermedades genéticas, analizando aproximadamente 1000 trastornos y secuenciando 3,7 millones de recién nacidos en los Estados Unidos anualmente.

Los coautores incluyen: Stephen F. Kingsmore, Laurie D. Smith, Chris M. Kunard, Matthew Bainbridge, Sergey Batalov, Wendy Benson, Eric Blincow, Sara Caylor, Christina Chambers, Guillermo Del Angel, David P. Dimmock, Yan Ding, Katarzyna Ellsworth, Annette Feigenbaum , Erwin Frise, Robert C. Green, Lucia Guidugli, Kevin P. Hall, Christian Hansen, Charlotte A. Hobbs, Scott D. Kahn, Mark Kiel, Luca Van Der Kraan, Chad Krilow, Yong H. Kwon, Lakshminarasimha Madhavrao, Jennie Le, Sebastien Lefebvre, Rebecca Mardach, Bill Mowrey, Danny Oh, Mallory J. Owen, George Powley, Gunter Scharer, Seth Shelnutt, Mari Tokita, Shyamal S. Mehtalia, Albert Oriol, Stavros Papadopoulos, James Perry, Edwin Rosales, Erica Sanford , Steve Schwartz, Duke Tran, Martin G. Reese, Meredith Wright, Narayanan Veeraraghavan, Kristen Wigby, Mary J. Willis, Aaron R. Wolen, Thomas Defay

La financiación de esta investigación provino, en parte, de: una subvención del Centro Nacional para el Avance de las Ciencias Traslacionales (NCATS) a EJ Topol (con sub-adjudicación al Dr. Kingsmore), RCIGM y Rady Children’s Hospital – San Diego, una subvención de Alexion y Travere Therapeutics, y apoyo en especie de Alexion, Illumina, TileDB, Genomenon y Fabric Genomics.

Estudio completo: Un sistema de secuenciación del genoma para la detección universal de recién nacidos, el diagnóstico y la medicina de precisión para enfermedades genéticas graves. DOI: 10.1016/j.ajhg.2022.08.003

Acerca del Instituto de Medicina Genómica Rady Children’s

Estamos transformando la atención crítica pediátrica mediante el avance de la atención médica específica de enfermedades para bebés y niños con enfermedades raras. Los descubrimientos del Instituto están permitiendo un diagnóstico rápido y un tratamiento específico de recién nacidos y pacientes pediátricos críticamente enfermos en el Rady Children’s Hospital-San Diego y una red creciente de más de 80 hospitales infantiles en todo el país. La visión es ampliar la entrega de esta tecnología que cambia la vida para permitir la práctica de Rapid Precision Medicine™ en los hospitales de niños de todo el país y el mundo. RCIGM es un instituto de investigación sin fines de lucro integrado en el Hospital y Centro de Salud Infantil Rady. Obtenga más información en RadyGenomics.org. Siga con nosotros Gorjeo y LinkedIn.


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